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南京是中國重要的科研教育基地，擁有多所知名軍校。截至2023年10月，南京共有6所軍校，分別為陸軍指揮學院、陸軍工程大學、海軍指揮學院、國防大學政治學院南京校區、國防科技大學南京校區、陸軍炮兵防空兵學院南京校區。以下是這些軍校的相關資訊。
陸軍指揮學院：地處有「六朝古都」之稱的江蘇省南京市，級別為正軍級，其前身是組建於1953年的原解放軍總高級步兵學校。學院是陸軍的最高軍事學府，設有8個軍事學一級學科、1個國家重點建設學科、3個軍隊重點建設學科，具備碩士、博士授予資格。
陸軍工程大學：是隸屬陸軍的一所副軍級專業類高等教育院校，校本部位於江蘇南京，目前下轄5個內設分院（即：通訊工程學院、野戰工程學院、指揮控制工程學院、國防工程學院、研究生院）以及石家莊校區、通訊士官學校和訓練基地。該大學是在此輪軍改中新組建的軍校，由原解放軍理工大學、原軍械工程學院主體和原重慶通訊學院、原工程兵學院、原武漢軍械士官學校合並組建而成，主要負責開展生長軍官高等教育、研究生教育、士官職業技術教育、外軍留學生教育，涵蓋陸軍資訊保障、工程兵、裝備保障、電子對抗、無人作戰、大數據等諸多專業領域。
海軍指揮學院：和陸軍指揮學院一樣是正軍級，學校坐落在江蘇南京，在性質定位上屬於海軍中級任職教育院校，目前是海軍最高學府，有半山園和浦口兩個校區（共占地1178畝）。在任務職能上，海軍指揮學院主要培養海軍中級指揮與參謀軍官、海軍軍事學博士、碩士研究生，以及其他軍種部份指揮與參謀軍官，同時肩負創新海軍軍事理論的重要使命。
國防大學政治學院南京校區：2017年8月26日，國防大學下屬八大學院之一的政治學院組建成立，級別為副軍級（前身是原南京政治學院、原西安政治學院和原武警政治學院）。需要指出的是，國防大學政治學院雖然只是二級學院，但卻在上海、西安、南京同時辦學，目前其本部機關設在上海市松江區，另外在南京市鼓樓區部署著南京教學區、在西安市碑林區設有西安校區、在上海市楊浦區則部署了楊浦教學區。
國防科技大學南京校區：國防科技大學的前身是建立於1953年的解放軍軍事工程學院（位於哈爾濱），學院主體後於1970年南遷長沙，改名為「長沙工學院」。1978年，長沙工學院改建為解放軍國防科學技術大學；到了1999年，解放軍國防科學技術大學有所擴大，吸收合並了原長沙炮兵學院、原長沙工程兵學院和原長沙政治學院。2017年，以原國防科學技術大學為基礎，再劃入原國際關系學院、原國防資訊學院、原西安通訊學院、原電子工程學院和原解放軍理工大學氣象海洋學院等軍校，合並組建了正軍級的國防科技大學，歸軍委建制領導。目前，國防科技大學的本部位於湖南長沙，同時設有南京校區、武漢校區、合肥校區、西安校區。
陸軍炮兵防空兵學院南京校區：陸軍炮兵防空兵學院是此輪軍改中陸軍新組建的一所副軍級軍校（具體成立時間是2017年7月），目前主要承擔炮兵、防空兵指揮軍官培訓任務以及承擔博士/碩士研究生教育、現職幹部培訓、文職人員培訓、士官教育和外軍留學生培訓等任務。和其他軍校一樣，陸軍炮兵防空兵學院也是在多所軍校基礎上合並組建而成的，而其組建基礎分別是原陸軍軍官學院、原南京炮兵學院、原防空兵學院、原沈陽炮兵學院。當前，陸軍炮兵防空兵學院的院本部設在合肥，同時設有南京校區、鄭州校區和士官學校，其中南京校區的前身就是原南京炮兵學院、鄭州校區的前身原防空兵學院、士官學校的前身是原沈陽炮兵學院。
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