這段時間，菲律賓在南海異常活躍，經常到南海碰瓷，菲律賓碰瓷的主要目標有兩個，一個是仁愛礁，另一個則是黃巖島。
只不過隨著中國對仁愛礁及其附近海域的控制不斷加強，菲律賓逐漸發現，那艘擱淺的破船不僅起不到任何作用，還在進行補給時，成為中國海警重點「關照」的物件，所以菲律賓只好又將精力放在黃巖島上。
菲海警4411艦有外媒記者對我艦正當維權執法行動進行拍攝
黃巖島雖然只是一個面積只有約150平方公裏的島礁，但這裏卻一直紛爭不斷，1997年~2012年，這裏曾被菲律賓霸占長達15年之久，後來中國經過多方面的鬥爭，才終於奪回了黃巖島的實際控制權，但菲律賓依舊賊心不死，直到今天還在覬覦黃巖島。
菲律賓侵占黃巖島的方式也很並不稀奇，基本就是開執法船宣誓主權，鼓動菲漁民闖潟湖，再就是拉記者拍照抹黑。
對此，中國海警也有一套應對策略，如果是菲漁民誤闖潟湖，我方只需要在黃巖島入口處安裝浮動屏障就行，因為黃巖島潟湖是個C字形，一旦封住東南角唯一的入口，菲漁民就沒有機會闖進來。
而如果是菲公務船，處理起來則更簡單，因為這屬於公然侵犯，我方一套水炮直接就可以讓菲律賓落荒而逃，所以在中國的嚴密控制下，菲律賓對黃巖島一些侵犯手段都無法實作，涉及領土主權問題，中國決不會有半分退讓。
那麽，菲律賓為什麽會對黃巖島這麽執著？菲律賓占領黃巖島的理由是什麽？中國奪回來的黃巖島，在南海有何特殊意義？
關於黃巖島的歷史記載，中國早在元朝時期就有記錄，當時黃巖島還是「四海測驗」的測量點之一，從那以後，黃巖島就被視為中國的固有領土被歷朝歷代標註在疆域版圖之上，黃巖島的中國主權鐵證如山，即使是抗戰時期，黃巖島仍作為中沙群島的一部份被列入南海中國版圖。
元朝官員郭守敬負責「四海測驗」
建國以後，中國又對黃巖島進行了長期的開發利用，1977年南海海洋研究所在島上設立了南海科考碑，1992年中國在黃巖島上升起第一面五星紅旗，1994年南海科考隊又在登島考察期間建立了水泥紀念碑。
而反觀菲律賓那邊，黃巖島歷史上幾乎從未出現在菲律賓的官方地圖之中，無論是1935年的菲律賓憲法，還是1981年、1984年菲律賓出版的官方地圖，黃巖島都被標準在其領土之外，所以從歷史角度來說，菲律賓擁有黃巖島的主權純屬無稽之談。
那麽既然沒有歷史依據，菲律賓為什麽還敢如此明目張膽的侵占黃巖島呢？其實是因為菲律賓有一套自己的說辭。
菲律賓的老宗主國美國就曾對外聲稱，黃巖島距離菲律賓更近，該礁位於菲律賓群島通常區域範圍內，距離菲律賓的呂宋島約240公裏，而距離中國海南島則有900公裏，所以從地理上來說，黃巖島應該屬於菲律賓。
美國的這種領土劃分理論在國際上叫做「地理鄰近論」，但因為這套理論無法支撐現實，而且存在很多漏洞，所以早就被棄用了，然而，菲律賓對此卻深信不疑，懷揣著這套謬論，菲律賓一直對外聲稱自己離黃巖島更近，擁有黃巖島的主權。
但這套理論如果被判定為合規，那世界上很多國家的領土版圖都要重新劃分，英法海峽中間的海峽群島離法國海岸只有6英裏，但它卻屬於英國，聖皮爾島、密複制島離加拿大紐芬蘭海岸只有12海裏，但它是大西洋彼岸的法國領土。
就連提出這種理論的美國，也面臨著夏威夷、關島等海外屬地的歸屬問題，所以「地理鄰近論」是站不住腳的，菲律賓以此為借口侵占黃巖島，更是荒謬至極。
除了「地理鄰近論」以外，菲律賓政府還提出了「專屬經濟區論」、「主權繼承論」等很多謬論，宣稱黃巖島在菲200海裏專屬經濟區內，理應屬於菲律賓，並在1992年率先發起爭端，要將黃巖島並入菲律賓領土。
1993年，菲律賓不顧中國警告，在黃巖島上進行勘測考察。
1997年，菲律賓海軍蓄意炸毀中國在黃巖島上設立的主權碑，並對進入黃巖島的中國漁民實施驅逐和抓捕，同時在國際上表明自己擁有黃巖島的主權，就這麽堂而皇之的霸占了黃巖島。
1999年，菲律賓軍艦在未作任何警告的情況下，悍然擊沈一艘停靠在黃巖島上的中國漁船，致使船上11人落水。
2012年4月，菲律賓軍艦再次襲擾黃巖島上的12艘中國漁船，並圍堵了一艘編號「瓊海09099號」的漁船，在扣押了船只後，手握長槍的菲律賓海軍又讓船長許德譚及船上的16名船員在烈日之下暴曬了近四個小時。
15年來，菲律賓在黃巖島屢屢挑起爭端威脅中國漁民，給中國的漁業捕撈工作造成了巨大損失，為了保護漁民的作業需要，避免類似的意外再次發生，中國在多次警告無果後，最終派出執法小艇進入潟湖，同時在外圍加強了警戒。
雖然在此期間菲律賓一直無視我方的警告，甚至還單方面切斷外交溝通，致使武裝威脅的情況一直持續了近半個月的時間，但在中國的強硬態度下，菲律賓最終還是結束了黃巖島，至此，被菲律賓霸占了15年之久的黃巖島終於重回中國。
實際上，菲律賓之所以會對黃巖島情有獨鐘，始終覬覦著這塊不屬於他們的領土，皆因黃巖島的資源太過豐富，黃巖島擁有非常豐富的礦產資源，鈷、鎳、銅、錳等30多種金屬都已經在黃巖島上被發現，附近還蘊藏著大量的石油與天然氣資源。
此外，黃巖島還是一座得天獨厚的天然漁場，這裏的石斑魚、雞尾魚、鰻魚等魚產十分豐富，在北部灣漁場和大陸棚漁場的開發潛力逐漸下降之際，黃巖島的漁業發展對中國擴寬中國漁業的南方邊界有著至關重要的作用。
所以黃巖島回歸後，中國立即在海南成立了三沙市，專門管轄西沙群島、中沙群島、南沙群島的島礁及其海域，對於中國來說，黃巖島不僅地理上的戰略要地，也是經濟資源的儲備基地，未來中國很有可能還會在黃巖島實施陸域吹填，黃巖島的開發已經勢不可擋。
