康熙十三年（1674年）四月十三日，也就在吴三桂弃用康熙年号建立大周政权（辖湖南、广东半部、广西、云南、贵州、四川、陕西南部小部分和甘肃南部小部分）自称周王不久，康熙帝立即将吴三桂的世子 吴应熊 还有吴三桂的孙子 吴世琳 处死，以震慑其他藩王。
「吴应熊及其子吴世琳处绞，其余幼子及公主俱免死幽禁」。
当时的吴三桂正在饮酒，他正沉浸在对未来的美好规划中。当听到儿子被杀时，吴三桂顿时脸色大变，浑身发抖，酒杯从手中滑落，摔到地上被打得粉碎！丧子、丧孙之痛，使他痛彻心扉，忍不住老泪纵横，长叹一声，说：「今日真是骑虎啊!」当即「魂迷意乱，气阻神昏」。
一、吴三桂造反前曾派人解救吴应熊
吴三桂有两个儿子，长子吴应熊。次子吴应麒，不过他已过继给吴三桂的哥哥。
吴应熊是吴三桂的妻子张氏所生，他一表人才，重情重义，是吴三桂的世子，以后是要世袭吴三桂的亲王爵位的。
因吴三桂兵权在握，曾在山海关前的一念之差，决定了清军的入关之路，清廷封吴三桂为「平西王」，管辖云南、贵州、四川等地权倾西南大地。
吴三桂的势力长期以来都为皇帝所忌惮。朝廷方面权衡利弊，由孝庄太后主婚，将皇太极的第十四女、13岁的 硕恪纯长公主 下嫁给吴三桂的儿子吴应熊。这样一来吴应熊就以额驸的身份留居京师，成为清廷的人质。
这场政治婚姻，表面上看是为了表彰吴三桂的功劳，实际上是为了威慑并束缚吴三桂，吴应熊的留京等于给吴三桂戴了个紧箍咒。
8年后，顺治帝驾崩了，多尔衮也死过11年了，6岁的康熙帝继位。就在康熙继位的第一年，吴三桂就送上一份大礼，他将南明永历帝朱由榔杀死于昆明。清廷晋封吴三桂为亲王，并命贵州省亦属管辖。吴三桂遂久镇云贵。
之前都是多尔衮和顺治帝和吴三桂打交道。自从他们两个不在后，康熙和吴三桂之间互不信任。天高皇帝远，吴三桂在边远之地犹如土皇帝，又娶妻生子，日子过得很潇洒。
在康熙帝19岁时，决定削藩，削三个汉族藩，即云南平西王吴三桂、广东平南王尚可喜、福建靖南王耿精忠。
也就是说，康熙帝要把以前明朝投降过来的汉族藩王都给削了，剥夺他们的军权、财权等一切权利，把他们削的片甲不留，如若再不听话就将他们轰成炮灰永绝后患。
康熙首先撤了尚可喜的藩王位，吴三桂心里七上八下的，「城门失火，殃及池鱼」，他自然知道下一个遭殃的就是他了，就算他不反也不会有好结局。
康熙杀鳌拜眼睛都不带眨一下的，他会允许吴三桂这样的人物活着？就算让他活着也是暂时的，早晚得清算，说不定会交给云南百姓，做他们的刀下鬼。再说，吴三桂当时有能力和清廷一决高下，他为什么不反？吴三桂不反就彻底成为刀板上的鱼肉，就算他不反，他身后所代表的利益集团也不会同意，他的二儿子吴应麒骁勇善战更加支持他造反。
从各方面来说吴三桂不反也得反。
这点也在康熙帝的意料之中。康熙认为，吴三桂和朝廷对立已久，
「撤亦反，不撤亦反。不若及今先发，犹可制也」。
由于吴三桂坐镇云南已有十四年之久，兵多将广在军事上积累了雄厚的实力，更是对周围的地形了如指掌，在反叛之初，叛军势如破竹，连下贵州全省，继而挺进湖南。
吴三桂的叛乱，如同一石激起千层浪，迅速在各地引起了连锁反应。福建靖南王、广东平南王二藩同样手握重兵，见吴三桂起事，纷纷揭竿而起，与吴三桂遥相呼应。
吴三桂在各地的党羽，更是如雨后春笋般涌现。如四川之郑蛟麟、谭弘、吴之茂，广西之罗森、孙延龄，陕西之王辅臣，河南之蔡禄等也先后揭起叛旗，纷纷响应。一时之间，形势对吴三桂相当有利。
此时的吴应熊和建宁公主已结婚21年，建宁公主先后为吴应熊生育了五个孩子，长子吴世璠，次子吴世琳，夫妻感情深厚。
吴三桂考虑到自己在京城的子孙后代，在起兵前夕，特别交代密使偷偷去京城，将儿子吴应熊及孙子接出来，可令他万万没想到是，在宫中待了20多年的吴应熊很留恋那里，他放不下妻子，说什么也不肯回昆明，他存在侥幸心理，认为康熙看在建宁公主的面子上不会那么绝情。他把康熙帝「将提前削藩之策」告知吴三桂，让使者将大儿子吴世璠秘密带出了京师。
二、、康熙帝不顾姑姑的哀求，处死她的丈夫和儿子
康熙帝马上派专使至滇，雷厉风行地进行撤藩事宜。康熙十二年（1673年）十一月，吴三桂诛杀云南巡抚朱国治，自称天下都招讨兵马大元帅，提出「兴明讨虏」，起兵造反。
吴三桂的反叛引起了康熙的高度警觉。为了杜绝吴三桂和吴应熊的里应外合，他立刻将吴应熊拘禁投入大牢。朝中纳兰明珠等一些大臣，纷纷请求将吴应熊和吴世琳处死，以绝后患。
吴应熊夫妻二人十分恩爱，建宁公主苦苦哀求侄子康熙帝，求他放过吴应熊及儿子，康熙帝看在姑姑的面子上不忍心杀吴应熊，但为大局考虑，不得不杀。就这样，吴应熊和儿子吴世霖被残忍处死。建宁公主悲痛欲绝，后悔那晚没有让吴应熊及儿子早点逃出京师。
三、吴三桂的反击
吴三桂听闻子孙惨遭毒手的噩耗，他心如刀绞，失望、痛心、愤恨一齐涌向心头，几乎窒息昏厥，他后悔将康熙想的太肤浅了，他以为康熙会顾及其子与清廷的关系而不致伤害，20多年来吴应熊对清廷忠心耿耿，是康熙帝亲封的少傅兼太子太傅，「初得湖南还望生得其子。」吴三桂曾以为，加上他的势力足以让康熙帝投鼠忌器，不会轻易对吴家下手。可谁知看似荣耀无限，实则步步惊心。
如今子孙都被杀死，他才意识到康熙远非他想的那般低能，现实以最残酷的方式告诉他，在权力的游戏中，没有永远的盟友，只有永恒的利益！康熙帝，这位看似温文尔雅的年轻帝王，实则心深似海，手段狠辣，远非他所能揣度。
吴三桂懊悔不已，但已成骑虎之势，只好硬着头皮拼下去，为了子孙的血不白流也要拼下去。
他的孙子吴世璠被解救到云南后，康熙帝紧锣密鼓对其搜捕，他下令包围「斩草除根」， 吴三桂起兵时，让吴世璠留居云南。
可是，吴三桂的叛乱之路并非一帆风顺。随着战事的深入，清廷逐渐稳住了阵脚，开始调集全国之力进行平叛。康熙帝展现出了非凡的政治智慧和军事才能，他一方面派遣重兵围剿叛军，另一方面则采取分化瓦解的策略，进行离间吴三桂与其他叛军之间的关系。接着，王辅臣投降，耿精忠反正，尚之信归顺清廷……
吴三桂做着垂死挣扎。
四、吴三桂称帝
康熙十七年（1678年），衡州衡山之巅，云雾缭绕之中，吴三桂为了鼓舞士气，在此设坛，举行称帝大典，国号为周，年号昭武，以衡州为「定天府」。他望着人间美景，内心深处充满了对皇权无上荣耀的渴望与向往。吴三桂从降清封王到反清复明，到登基称帝，他所走的每一步都深刻地影响着历史的进程。
为了巩固新政权，吴三桂进行了一系列的人事调整与军事部署。他吴应熊的生母张氏为皇后，立吴应熊的唯一活下来的儿子孙吴世璠为皇太孙。同时，他重用亲信，让女婿郭壮图、方光琛等，为大学士，参与国家大事的决策，形成了以自己为核心的权力网络。
在军事上，他设立云南五军府兵马司，改留守六曹为六部，加强了对军队的控制与调度。此外，他还晋封胡国柱、吴应麒等人为大将军，王公良、巴养元等人为将军，并赐予他们国公、郡公、侯、伯等爵位，以激励士气，稳固军心。
正在举行称帝仪式时间，突然风雨大作，吴三桂的登基典礼短暂而仓促，成为吴三桂一生的遗憾。
吴三桂虽然完成了称帝的梦想，吴三桂的叛军虽然勇猛善战，但终究难抵康熙所派的大军的围剿。加上吴三桂的内部各将领之间因利益纷争而暗流涌动，战斗力急剧下降，另外民心向背，使吴三桂的「周」国的统治摇摇欲坠。再加上吴三桂本人年事已高，这位昔日曾驰骋疆场、威风凛凛的平西王对于局势的掌控已不尽如意。
到了康熙十七年（1678年）八月，吴三桂得了不治之症「中风噎嗝」、「下痢」， 即便是宫中太医倾尽所能，用尽奇珍异药，也终究无力回天。吴三桂自知将不久于人世，赶紧让心腹大臣，接皇孙吴世璠来衡州继位。吴三桂只做了五个多月的皇帝就病死了。
为了稳定大局防止军心涣散，叛军对吴三桂秘不发丧。
五、吴世璠的即位
总理军务 吴国贵 ，派吴三桂部将胡心水之子 胡国柱 回云南，迎吴世璠前来衡州奔丧。
当吴三桂的心腹将领胡国柱到达云南要接回吴世璠时，却遭到吴三桂的女婿郭壮图的反对。郭壮图的女儿嫁给了吴世璠，卫朴的女儿也嫁给了吴世璠，他要帮女儿与卫朴之女争皇后位，因而坚决不让吴世璠去衡州。
无论胡国柱怎么劝说，壮图就是不听，胡国柱气急大哭，在城外东郊来回徘徊许多天，痛哭流涕，郭壮图丝毫不为所动。
胡国柱只好回去，用棉裹吴三桂遗体，秘密运往常德，再辗转送回贵州、云南。吴世璠没有去衡州，只迎至贵阳，并在此即帝位，以贵阳府贡院为其行在，定明年为「洪化」元年（康熙十八年），给其祖父上尊号「太祖高皇帝」，父吴应熊为「孝恭皇帝」。
当吴世璠召顾命大臣曹申吉等人赴云南时，只有曹申吉听调应命，其余皆托故不到。
更为不祥的是，吴世璠即位之日，天象异常，为女儿争到皇后位的胡国柱在筑坛代祭时遭遇「阴风疾起，灯烛皆灭」的诡异景象。这一幕，被后世史学家视为天意难违、吴氏气数已尽的象征。
六、面对清军的进攻打，逃跑加窝里斗
吴世璠虽匆匆继位，但面对内忧外患的严峻形势，难以独撑大局。经过一系列的变故，吴军军心涣散，面对清军的攻城，坚守岳州的吴三桂的侄子 吴应期 弃城逃跑，清军蜂拥渡江如入无人之境，吴军全线溃退。吴应期、胡国柱、王绪等一溜烟逃到辰州。
吴应期从湖南逃到贵州，去朝见逃到昆明的吴世璠，把一切责任推到方光琛身上，内部互相倾轧。
随从吴世璠从贵阳逃回云南的吴应期，有了叛变之心。他一路上招集散逃兵士，没有去昆明，而是在交水（今曲靖附近交河）驻扎。他打算继续集结逃散的吴军，然后回昆明搞宫廷政变，废黜吴世璠，取而代之。
吴应期的反常举动引起郭壮图的注意，他识破了吴应期的险恶用心，马上派遣吴将线率军前去，用计策骗过吴应期，当场用绳子勒死了他。接着郭壮图又把吴应期的两个儿子吴世琚和吴世珵一并勒死。
吴应期父子一死，吴氏政权完全被郭壮图掌控。才16岁的吴世璠，面对内部倾轧，骨肉相残；面对吴氏政权逐步削弱，人心的涣散，根本无所适从，整个吴氏集团陷入了前所未有的困境。
清兵围城半年多，吴世璠盼望马宝等人的救援早已化为泡影，但他们仍不愿投降。清军向城内射出一封封招降书，吴世璠拒绝投降。城内已断粮食，守城将领也无心作战，打算早降。
余从龙、吴成鳌偷偷投降清军，将城中军情出卖。吴将线、吴国柱、吴世吉、原任都统何进忠、林天擎等密谋，准备发动兵变，欲逮捕吴世璠、郭壮图献给清军。
七、吴氏政权的灭亡
康熙二十年（1681年）十月二十八日，16岁的吴世璠陷入四面楚歌、孤立无援的绝境，他立即穿上皇帝的服装，登临大殿，他的眼中没有恐惧，只有决绝与解脱，他举刀自刎，一刀未死，又朝喉管抹了一刀，血流如注，一头栽倒在血泊之中。
他的皇后郭氏也展现出了令人动容的忠贞与决绝，她没有选择苟且偷生，上吊自杀。宫中从死的达百余人，有的是自幼陪伴吴世璠长大的贴身侍卫，有的是对皇室充满敬仰与忠诚的宫女……
也就在同一年，建宁公主所生的其他幼子，还有吴应熊的所有庶子，也被康熙帝一并处死。39岁的建宁公主彻底被击垮，她失去了丈夫的依靠，时隔7年她听闻她牵肠挂肚的长子自刎、又一次亲眼目睹幼子的惨死，心中的痛苦和绝望可想而知。
吴将线砍下吴世璠的头颅，带兵丁闯入郭壮图家，杀死郭壮图心腹郭得胜。郭壮图和儿子郭宗汾皆挥剑自刎。
接着吴将线等将官打开昆明城门，向清军投降，吴世璠的首级及夏国相、马宝等人被押解到北京。历时八年的三藩之乱结束，康熙取得了彻底的胜利。
康熙对吴三桂恨之入骨，死后也没有放过他。1682年正月，他下令将死去4年之久的吴三桂剖棺戮尸，付之一炬扬其灰，以警告那些不忠不孝的臣子，并将吴世璠的首级交刑部悬挂城门示众，将吴三桂的女婿夏国相凌迟处死。
怂恿吴三桂起兵并为其谋划的 方光琛 和他的侄子 方学范 、儿子 方学潜 被擒获后立即处死。马宝虽然投降，但他罪大恶极，而且是在走投无路的时候才投降的，不能饶恕，康熙下令，将马宝押赴到京，凌迟处死。
建宁公主成了清朝最悲惨的公主，作为无子无夫的孤寡老人，在深宫中凄凉度日，夫妻永不能再见，母子永不能相逢，最终抑郁而终。
总结：
吴三桂投降了清军，为清军卖命差点认满清为祖宗，他亲手将南明永历帝勒死在十字坡，还 杀害了朱由榔的儿子以及眷属，共计25人。他 为满清奋斗了大半生后，又 打着反清复明的旗号走向反叛之路，导致他最爱的儿子吴应熊被杀，当得知自己失去了可以倚重的儿子时 吴三桂心如刀绞，脸色大变，双手颤抖，他深知，自己已失去了最宝贵的依靠和寄托。
吴三桂儿孙的被杀，导致后继无能人，最终家破藩撤。 可怜建宁公主沦为政治的牺牲品，孤独活了30年抑郁而终。
