蔣介石對軍隊的控制是很嚴格的，部隊主官的任命，必須要求嫡系裏忠心耿耿的人擔任。
能夠讓蔣介石揪心的多半也是嫡系主力部隊，最主流的是這三支部隊，直接聽命於他的機動作戰部隊。
任何一支處於危險之中，蔣介石的神經就會高度緊張，直接幹預營救工作。
第一支是74軍，這支部隊成立於1937年，由蔣介石的衛戍隊長俞濟時擔任軍長。這支部隊蔣介石是可以隨意指揮的，物資、人員補給是一流的。抗戰時資源緊張，別的部隊至少一半的糧食必須自籌，74軍則無此考慮。
養兵千日，用兵一時。在使用上，蔣介石也把74軍當成主角來用。1937年淞滬會戰、南京保衛戰，38年的蘭封會戰、武漢會戰。39年南昌會戰，40年三次長沙戰役，42年浙贛會戰，43年鄂西會戰。74軍是國軍中最忙碌的部隊，關系國運存亡，別的部隊未必能頂得住日軍。蔣介石只能用自己最信任的部隊，74軍打光了補，補了再打，幾乎打滿抗戰全場。打出了中國軍隊的虎威，74軍兩次榮獲國府抗戰時期最高獎勵「飛虎旗」，榮獲「抗日鐵軍」、「虎賁師」。
湧現出不少抗戰名將，如王耀武、李天霞、施中誠、余程萬、張靈甫等優秀軍人。為了改造抗戰一潰千裏的風氣，蔣介石對臨陣脫逃的將領的處罰確實非常嚴厲，對嫡系部隊也不姑息。他槍斃了74軍58師的師長廖齡奇，盡管這是一起冤案，但是部隊打敗仗了就要受到處理。可見74軍的一舉一動全在蔣介石的眼中。74軍的實力與日軍一流師團基本相當，比日軍王牌還是略有不足。但是架不住蔣介石對74軍的重視，補人補槍很及時很到位，該軍也很滿意，情緒很穩定。
在上高會戰中，師長李天霞指揮的51師在教鼓嶺、豬頭山與日軍激戰，場面極其壯觀。日軍出動飛機百多架，投下的炸彈就有1700多枚。日軍大賀師團長親自督戰，反復地轟炸74軍陣地，在歷時25天的戰鬥中，王耀武、李天霞殲滅敵軍少將指揮官巖永以下15000余人，被何應欽稱為「抗戰以來最精彩之戰」。到了解放戰爭中以後，74軍改編為74師。
成為華東地區國民黨軍隊機動部隊突擊的兩把尖刀之一，另一支部隊為25軍。不過孟良崮戰役中，張靈甫孤軍冒進，遭遇華野30萬主力部隊的包圍。蔣介石非常揪心，急於救出74師，在不恰當的戰場，調動一兵團及周邊部隊，企圖反包圍華野主力。國民黨飛機大炮強悍，但是山地機械化是沒什麽大用的。結果可想而知，74師全軍覆沒。蔣介石傷心不已，將一艘軍艦取名為靈甫號。
第二支部隊是國民黨25軍，25軍名氣很一般，也算是嫡系，更算是嫡系中的雜牌。25軍的成員來自東北、四川、廣東等地。25軍為蔣介石所重視還是解放戰爭中的事，當蔣介石的名牌部隊，名將對陣解放軍力不從心，紛紛折戟。能與解放軍對抗戰的部隊寥若晨星，連18軍這樣的五大主力部隊，對抗解放軍也只能守得住而已，戰勝遠遠談不上。但25軍卻經常讓蔣介石眼睛一亮，孟良崮戰役中，對國民黨五大主力之首74師，救援最積極的就時任整編25師師長的黃百韜。
若不是天馬山戰鬥中，華野一縱的師長廖政國，關鍵時刻攔下陶勇任司令員的第四縱隊一個營，這場戰役誰勝誰負，還非常難說。這是一支少有的，對抗解放軍不處下風的部隊。時常給蔣介石帶來驚喜，信任之下，將從未使用過的傘兵部隊和第三快速縱隊調配給25軍，這可是其他嫡系部隊夢寐以求的事情。25軍不辱使命，多次救下國民黨王牌部隊。以優異的戰績甩開其他嫡系將領，成為第七兵團司令官。
非嫡系將領能當上兵團司令是非常少見的，也是蔣介石制衡嫡系將領的殺手鐧，戰績不好，嫡系也不頂用，誰能力強用誰。當然這也引起了嫡系們的嫉恨，當第七兵團在碾莊被包圍，蔣介石方才看出不妙，他又一次幹涉了戰役，指揮其他國民黨部隊解救第七兵團。由於太在意以25軍為主的第七兵團的得失，錯過了戰役的主動權，導致淮海戰役蔣介石的嫡系全軍覆沒。
第三支部隊是在湖南湘潭成立的國民黨五軍，這是國民黨第一支機械化部隊。抗戰初期日軍的機械化軍隊對國民黨軍極為致命，在徐庭瑤的建議下，國民黨又向德國購買了17輛輕型坦克和12輛裝甲車。1938年，又購入蘇聯T26坦克、意大利CV33坦克，並正式開始培養中國的裝甲兵。輜重兵團已經被擴編成第200師，隨後繼續擴編為第11軍。不久後，新11師改成第五軍。此時，蔣介石的王牌軍正式亮相，杜聿明為代理軍長。因為蔣介石十分珍視第五軍這支部隊，寧可讓74軍疲勞應戰，也舍不得動用第五軍上戰場。
1939年11月，日軍已經打到南寧，昆侖關正面對的就是日軍第五師團。要知道日軍第五師團可是號稱「鋼軍」，非常難對付，蔣介石終於亮出了自己的王牌，派出五軍出陣一試身手。昆侖關一戰，第五軍團擊斃了日本少將中村正雄，日軍第二十一旅團85%的軍官陣亡，死亡士兵4000多人，第五軍一戰成名。接著五軍加入遠征軍序列，給日寇帶去了沈重的打擊。在解放戰爭前期，一直都是該時期十分難對付的一支國民黨部隊。但是隨著第五軍的軍長更叠，第五軍的戰鬥力就不再穩定了，在熊笑三任第五軍軍長時，第五軍更是一路滑坡。
在解救第七兵團的時候，邱清泉所帶領的第二兵團就已經讓蔣介石十分失望了。但是蔣介石還是隱瞞了第七兵團覆沒的訊息，令十二兵團向徐州開進，以期待幾個主力兵團能一起結束徐州，但十二兵團在苦撐一個月後，全軍覆沒，只剩下陳官莊包圍圈的五軍。
蔣介石此刻的心情，就像一個賭徒輸光了手上的全部籌碼一樣。
沒多久，蔣介石萬念俱灰，宣布下野，將權力拱手讓給了桂系。
