一九四二年二月，清河行署公安局調任芳亭去博興縣接任公安局長霍瑛的職務。當時博興鬥爭環境比較艱苦，敵情嚴重，敵強我弱，鬥爭形勢緊張並日趨惡化。
博興縣位於小清河兩岸，南臨桓台、臨淄，北臨蒲台，東臨廣饒，西靠高苑，處在黃河以南，膠濟鐵路以北的中心地帶。更重要的是，接連我膠東、清河、冀魯邊三個戰略區的交通幹線滄（縣）濰（縣）公路縱穿博興。因此，這裏是敵我必爭之地。
一九三九年一月，日寇侵占博興城。從一九四一年下半年起，日寇為加強統治，實行重點進攻，重兵盤據，據點、碉堡星羅棋布。僅博興城北公路兩側十五華裏的範圍內，就安上了北極宮、天齊廟、劉家寨、董王、王集、王木匠村等七處據點。這些據點，北與蒲台的日偽，南與盤踞在安家莊偽頑周勝芳聯在一起，
日寇同時對我抗日軍民實行「經濟封鎖」「蠶食政策」「三光政策」、「治安強化運動」，清剿掃蕩瘋狂到了極點。在這樣嚴重的情況下，博興縣的抗日軍民在黨的統一領導下針鋒相對地展開了英勇的鬥爭。
上級指示任芳亭，他「在博興的主要任務是加強公安工作，積極的開展對敵鬥爭，開辟新區，擴大和鞏固抗日根據地」。任芳亭到博興後在縣委的領導下，與各區剛建立起來的區中隊攜手，與敵人展開了一場極其尖銳的、復雜且持久的殘酷鬥爭。
經與縣委領導同誌研究，任芳亭首先決定開啟六區的局面。
六區位於博興的東部，北臨廣饒，是處於小清河北岸的廣博邊緣地帶。主要村莊有閻坊、樓子韓、高家渡、屯田、龍住河、毛家道口等，是一個產糧區。六區已經有了我區委和政權組織。這個區雖無敵人的據點，但大部份都被敵人控制。我方能公開活動的村不多，鬥爭相當激烈。區長是馬俊怡，有個不到二十人的區中隊。
偽頑周勝芳的二營劉子剛、廣饒的偽十六旅一團李青山的特務營陳瑞水活動在這一帶，與村中一些封建勢力、地主惡霸勾結。便衣特務隊、大股小股匪特公開駐紮在閻家坊東的村，催糧逼款，抓壯丁，綁票，敲詐勒索，強奸婦女，搞得群眾家破人亡，傾家蕩產。不少村的群眾不敢在家安睡，民不聊生，民怨鼎沸。
縣委決定由任芳亭帶領公安局全部武裝力量及大部份幹部前往六區開辟工作，有公安局政衛隊、區中區六十余人，加上民兵骨幹共一百多人。
任芳亭率這支武裝力量進入六區以後，開始住在基礎比較好的閻家坊、樓子韓、高家渡一帶，敵人夜間活動的村他們們白天去，敵人白天活動的村他們夜間去，和敵人展開拉鋸鬥爭，以武裝鬥爭形式，打擊敵人小股活動，後來逐步向東發展，最後開啟局面，掌握了主動權，左右了這個地區的形勢。
他們每到一村就開大會，宣傳抗日救國和共產黨的主張，說明他們是共產黨領導的八路軍開過來了，專打日寇、漢奸，保衛老百姓。一百多人的部隊，行動起來很像那麽一回事，老百姓聽了都拍手稱快，奔走相告說：「我們的八路軍大部隊過來了。」
六區除去鬼子掃蕩，暫時沒有大股的敵人活動，對於陳瑞水、劉子剛這樣的小股特務，一旦發現，任芳亭就率隊包剿圍打。一次陳瑞水的特務營到了營李村，任芳亭接到報告，馬上帶隊趕到，把他們打跑了，特務隊長當場被擊斃，打傷匪徒兩名，繳獲匣槍一支。挨的打多了，敵人不敢輕易到六區露頭活動了，我區政府的地盤迅速擴大。就連安著據點的毛家道口村的偽村長高十五，也在夜間和任芳亭他們聯系，為我方辦事。
任芳亭的另一個工作重心就是抓政權建設。一個村有了我方政權，群眾就有了主心骨，有了依靠。凡是開展工作的村莊，首先建立政權，有村長、農會、青抗先、自衛團、婦救會，兒童團等，這些村莊很快就變成了抗日根據地。
與此同時，任芳亭帶著同誌大力保衛群眾的生產。
鄭官村到廣饊的石村之間，有一個大窪，土地肥沃，因敵人的綁架活動，這片地群眾不敢去種了。政衛隊、區中隊就換上便衣，帶上武器幫助群眾一塊去種地，一塊去管理，一塊去收割，把這一大片土地全部耕種起來了，群眾收入很好，情緒很高。博興縣公安局因此在這一帶的群眾中，享有相當高的威信，真正和群眾建立了魚水關系。
隊伍和敵人打了仗後，各村群眾都來慰勞，以示對子弟兵的關懷。任芳亭率隊在這裏堅持了一年多的時間，六區完全成為我根據地，是我抗日武裝的可靠後方了。
一九四三年冬，博興公安局又深入到博興城北開辟一、八區的工作。一區和八區原來是一個區，叫一區。任芳亭到博興縣以後不久，從一區劃出了一個八區。
一、八區是博興蒲台的日偽互相聯系的橋梁地帶。開辟好一、八區，就切斷了博興、蒲台日偽的互相聯系。
一、八區黨的地下組織基礎比較好，內線工作很有成績，在敵人內部有關系、有內線，還有我派遣人員。敵人城裏的警察局、警備隊，各個據點都有我方的人。在農村兩面政權搞的也不錯，多數的偽鄉保長明裏應付敵人，暗裏為我工作。但敵人也知道這個地區的重要，在交通要道，重要村莊，安了不少據點，如開齊廟、北極宮、劉家寨、王木匠以及蒲台縣的小營都安上了炮樓和據點。這對任芳亭他們開展這個地區的工作，增加了一定的困難。
任芳亭對開展一、八區的工作，采取了雙管齊下，文武兼用的方法。武以武裝鬥爭，打擊敵人的囂張氣焰；文以開展政治攻勢，分化瓦解偽軍。還給偽軍建立了「紅黑」點登記，做件好事，點個紅點，做件壞事，點個黑點，對於作惡多端，民憤極大的鐵桿漢奸，縣公安局抓住就槍決，並出布告，把黑點給他附在布告上，以收打一儆百的效果。這樣的鬥爭，如兩打北極官，雙取天齊廟，奇襲劉家寨等，大滅了敵人的囂張氣焰。
任芳亭他們要打擊敵人，可以隨時出擊；而敵人要打他們時，黨的地下組織、內線關系、兩面政權把他們掩護得敵人根本摸不到邊。對敵打擊與對敵瓦解又密切結合。
王木匠據點為防止公安局的突然襲擊，據點周圍不讓群眾種地，種上後不等長起來，就被割掉。群眾去種地時，炮樓上亂開槍，群眾就不敢去種了，造成群眾生活的困難。據公安局統計，有三百多畝地群眾不敢去種。
任芳亭率隊兩打北極官，處決了鐵桿漢奸「獨眼龍」後，讓偽保長給王木匠據點的漢奸中隊長捎進去信，說「如再禍害老百姓，北極官‘獨眼龍’就是你的下場」。這下可把偽中隊長嚇壞了，和偽保長說：「請你轉告公安局，咱都是中國人，今後不再死心塌地為鬼子效力。」並囑咐偽保長說：「這些話你千萬不要告訴鬼子。」
後來任芳亭又捎信給偽中隊長說：「如果你要留後路，可派出聯絡員和我們聯系。」偽中隊長真的派出了聯絡員，還給他們送出了二十發子彈。任芳亭告訴聯絡員：「你回去告訴你們中隊長，老百姓要吃飯，你們不讓老百姓種地，沒有糧食吃什麽？只要你們不禍害老百姓，我們可以讓老百姓給你們拿糧，讓你們吃上飯，如果不聽我勸告，那對你們是決不客氣的。」
王木匠據點的敵人真的照辦了，但群眾仍有畏懼心理，不敢去種地。後來，任芳亭就派政衛隊化裝成老百姓在據點周圍種上八十多畝地，群眾在外圈裏種地，這片土地從而就利用起來了。有時據點裏也向空中打幾槍，那完全是為了應付鬼子。鬼子打電話跟據點裏說：「種地的八路的有。」他們回話：「八路的沒有，統統的是老百姓。」鬼子拿他們沒有辦法。
一、八區爭取偽軍的工作做得比較好，其中很重要的一手是做偽軍家屬的工作。楊國夫司令員住在博興八區，向博興縣公安局要情報，任芳亭就派人找到偽軍家屬捎個信，博興城裏馬上就送出真實的情報，第二天公安局就把情報送給楊司令。
鬼子幾次大掃蕩，任芳亭帶著公安局從來未離開過博興，都是化整為零，隱蔽在偽保長家和據點裏。在四二年春至四五年日寇投降的三年多的時間裏，博興縣公安局除去陳戶突圍時犧牲了三個同誌外，也再未受到大的損失。
日本投降後，四六年春天，博興縣公安局和縣委搬到小清河北的顧家村開展二、四區的工作。這時，博二區曹王一帶的大地主、惡霸都跑了，小的跑到張店，大的跑到濟南。地主的土地和浮財要分給群眾，群眾還不敢要。
公安局住在顧家一家地主院子裏，因房子不夠住，他們就自己動手脫坯，蓋了九間房子。為把工作迅速開展起來，公安局組織了工作隊到各村發動群眾開展反奸訴苦、土地改革、擁軍擁參，各項工作進行得都不錯，得到縣委的表揚。
公安局貫徹軍隊開展大生產的精神，「自己動手，豐衣足食」，減輕群眾負擔，做得也很有成效。在六區、八區和到了二、四區，公安局每年都種地、種菜，另外還做了些小買賣，安了些職業點。在柳橋開了油坊，在陳戶開了車行，在城裏開了醬菜園，在顧家還開了手工卷煙廠，除去自給外還有節余。
任芳亭在博興工作了五、六年，任內公安局很有名聲。政衛隊的短槍班，在群眾中有「神槍班」之稱。群眾送公安局「三好」榮譽，即打仗好，生產好，文娛活動好。
