1946年，四平保卫战结束后，洪学智被调黑龙江军区司令员，原司令员叶长庚改任副司令员。对于此项任命，主要是根据当时的形势发展决定的。
自抗战结束后，我根据地部队抽调挺进东北，展开建立根据地工作。同时，敌人也向东北运兵，从兵力对比，武器装备来说，我处于劣势明显。
当国民党军抵达东北后，政治土匪变得更为猖獗，在后方与国民党军遥相呼应。对我后方根据地建立破坏严重，为了有一个稳定大后方，剿匪建立根据地是第一位的。
像合江军区、嫩江军区、黑龙江军区都是大后方，但土匪非常猖獗。上级虽然派人前去剿匪，可并非主力部队，不仅兵力少，而且战斗力小。像黑龙江军区，上级调叶长庚为司令，跟他一起去的有几个干部，并没有多少兵。到北安后第一要务就是扩兵。
当地人得知部队要扩兵打土匪，还有点不敢相信，经过他们反复的宣传政策，不少人纷纷参军，军区在北安、绥化组建三个支队，相当于三个团。上级给这支部队配备一些干部，加强骨干力量。
尽管有部队，可部队毕竟是新部队，各方面经验需要加强。
上级之所以抽调洪学智前去，他此前在通辽负责过剿匪工作，更主要是形势紧张，因为敌人占领四平后，气焰嚣张。一旦哈尔滨、齐齐哈尔被占，又当如何。如今需要建立稳定后方。北安、黑河作为最北端的根据地，需要稳定，这样才能积蓄力量与敌人对抗。
因此最北端的根据地，就要加紧肃清土匪，而这里的部队都是新部队，一时半会解决不了问题。因此才调他去，他带着新四军3师特务1团，没有做停留就奔赴后方。
黑龙江军区的黑河匪患最严重，他来自之前就已经成了黑河军分区司令部，由王肃担任司令员，洪学智了解土匪分布情况后，进行分工。他带着特务1团到匪患最为严重的黑河地区剿匪，叶长庚率部到其他地方剿匪。
敌人有多猖獗，我黑河军分区司令员、政治部主任去北安开会遭遇土匪袭击，壮烈牺牲。
洪学智采取军事打击、政治瓦解、发动群众等手段。同时考虑到敌人可能会流窜到其他辖区，入嫩江、讷河，让其辖区部队主动堵截。
特务1团是主力部队，战斗经验是丰富的，他们首要对准的目标是刘山东，在行动中与其遭遇，2个营与刘山东部遭遇，土匪凭借人多势众，竟然大喊：缴枪不杀，抓活的。部队一看地形不利，就做好战斗准备，土匪从山上一窝蜂跑下来，部队轻重火力起开撂倒一片，俘虏200多人。
刘山东受到打击后，到处流窜，洪学智与合江军区方强联合作战，敌人站不住脚。随着大雪封山，敌人粮食快吃完了，没有粮食的土匪陷入困境，流窜补充粮食，被特务1团发现。部队集合就用迫击炮打，分两拨解决。
最大股敌人被歼灭，其他小股土匪逐一被剿灭。
到1947年初春，整个东北战场的局势迎来改变，随着三下江南，四保临江作战，东北部队积蓄力量开始战略反击，他被任命6纵司令，回到野战部队。
