孙白杨的父亲孙清华是太医院的院判，医术精湛。孙白杨天资聪颖，幼承庭训，十几岁便堪称国手，在太医院里出类拔萃，成为太医中的佼佼者。
孙白杨不仅医术高，而且心细如尘，对各宫小主娘娘因人制宜，对症下药，深得各宫主子的欢迎。她们掉发了会找孙白杨，面黄肌瘦会找他，为了变瘦，束腰节食晕倒了也请他。
孔武是来自乡间的一介武夫，因救驾有功，被封为四品御前侍卫。
孔武虽然来自底层，但是却善良、温厚。
他们的工作是和各宫嫔妃、宫女们打交道。在一大群女人，只有一个男人的后宫，两个优秀的男人变得如此的突出。
在和深宫寂寞的女人交集的过程中，他们滋生出了不该有的感情。这就是剧名中「欲孽」的出处。
但是，同样是爱皇上的女人，孙白杨和孔武在处理感情方面，却采取了截然不同的行为。
孔武的白月光是宫女安茜。因「丝帕情缘」，孔武对安茜一往情深。
为了安茜，孔武妥善安置她的奶奶，并说为奶奶在京城租一个茶果铺，奶奶可以一边卖糕点，一边等她出宫。
在鄂公公指使他外甥强奸安茜的危急时刻，又是孔武现身，将鄂公公和曹振南投进了井中。
曾几何时，孔武规划出了他和安茜以后的幸福生活。但是世事无常，安茜的奶奶死于非命。更可怕的事，竟然是皇后派人害死了安茜的奶奶。皇后的目的就是想把安茜留在宫中帮她宫斗。
为了给奶奶报仇，安茜费尽心机爬上龙床，做了皇上的安贵人。
不管以往孔武是如何的爱安茜，但是安茜做了贵人后，孔武就从心理和行动上彻底跟她划清了界限。他从没有费尽心机接近安茜，偶然相逢，也是波澜不惊、礼数周全，两人都克己复礼，让人挑不出一丝错误。
孔武和如妃也产生了感情纠葛。
如妃娘娘曾经宠冠后宫，手握协理六宫的权力，可以处死同在妃位的陈妃，她连皇后都不放在眼里，后宫嫔妃皆仰她鼻息。
这样的如妃娘娘，曾经对孔武这样的小小侍卫是不屑一顾的。但是，孔武遇见如妃的时候，她不再是往日里威风凛凛的如妃娘娘，而是失意的钮祜禄如玥。
如妃失宠，孔武失恋，两个落魄的人在人生低谷的时候，互相扶持走了一段人生之路。
为了女儿，如妃不得不听从皇后的命令，在冬日四处漏风的宫殿里抄写经书，因为惦记还在襁褓中的女儿，眼泪打湿了字迹，写了裁，裁了又写。
孔武见到了如妃的另外一面，无奈而柔软，只能把对小格格的挂念寄托在一只小鸟 身上，可是因为自己酒后失德，小鸟也被捂死了。
内疚的孔武开始帮助如妃去阿哥所见小格格，冒着风险一次不成就再安排一次，直到如妃能和小格格见上面。
如妃深夜抄经，他就煮酒在外守护；如妃患了雪盲症，他将米粒撒在门口，防她滑倒；在暖炉周围架起了风铃，防她烫伤。如妃在雪地里行走艰难，孔武背着她前行。
孔武事事体贴周到，给身处困境的如妃带去了无限温暖。
两人的情分虽然逐渐深厚，但是如妃在孔武面前一直保持着上位者的威严和庄重，孔武也守着奴才的规矩从来不敢僭越。
如妃复宠之后，孔武刻意和如妃保持距离。如妃喝骂见自己复宠又来巴结的奴才，她见孔武疏远，以为自己的话惹得孔武误会。可孔武却坦荡的说，自己从来都没有提防误会过娘娘。
孔武说：「娘娘如何对待他人自己无权过问，但是自己从来没有质疑过娘娘的友谊。之所以如此避嫌，是因为奶奶现在正得盛宠，为了不给娘娘惹麻烦，才更加刻意检点自己的行为。」
如妃是喜欢孔武的，但同时她也清醒的。她有看透感情的通达，她的喜欢更多的是成全。
而孔武对如妃也产生了不该有的感情，从后来孔武紧紧抓住如妃的手，不肯放开，要带她逃出宫可以看出来。但孔武也是理智冷静的，在知道会给自己和对方带来灾祸的情况下，他牢牢控制着自己的感情。
孔武理智地处理好了自己偏差的感情，但自诩「万花丛中过，片叶不沾身」的孙白杨，感情纠葛却处理的一塌糊涂，最后还送了性命。
侯佳玉莹是此届秀女中的佼佼者，天人之姿，明艳照人。
玉莹被尔淳等人陷害，换掉了她的汤药，导致她风疹迁延不愈，作为一个医术精湛的太医。孙白杨亲自去给她诊治。
孙白杨轻易就发现了玉莹装傻，其实她早就知道自己的药被换了，只不过她想通过太医的嘴揭穿尔淳。
对玉莹幼稚拙劣的宫斗手段，孙白杨感到可笑又可气，对她很是瞧不起。但随着时间的推移，他发现了玉莹率真、孝顺的一面，不知不觉，他爱上了玉莹，陷入感情的漩涡，不能自拔。
当然，开始时是孙白杨的单相思、单方面付出。
玉莹得罪如妃，为了救玉莹，他说玉莹患了传染病「虚寒疾」，把她拉出争斗的漩涡；他为玉莹母女作画以慰藉她思母之情，嘱咐福雅为玉莹编制手套，鼓励她打起精神东山再起，甚至亲自把玉莹送上皇上的龙床。
为了陷害安茜，玉莹写信给孙白杨，约他在畅音阁见。当然，她还以孙白杨的名义写信给尔淳，约尔淳在如意馆相见，目的是让安茜阻止孙白杨赴约，再抓个现行。
按说，皇帝的宠妃写信约定偷偷见面，是逾制的事，孙白杨作为资深御医，应该深知着一点。但是被爱情冲昏头脑的孙白杨，却飞蛾扑火，犯了大忌。
孙白杨被抓后，玉莹才发现自己也放不下孙白杨了。她向皇后自首，说约孙白杨相见，是为了求取禁药，取悦皇帝。所以玉莹被禁足，孙白杨被降级。
孙白杨难以放下玉莹，竟在尔淳和福雅的帮助下，去和玉莹约会。两人情难自已，做了最不该做的事，导致玉莹珠胎暗结。
孙白杨自己、玉莹、父亲、妻子以及家族、玉莹家族，因为他的一时情难自已，会有如何惨烈的后果，他竟然没有丝毫的考虑。
做人没有边界感，只顾眼下的快乐，明知冒险接触只能给双方带来灾难，又岂是真男子所为？
孙白杨本来是个见微知著、思维缜密的人，却被感情冲昏了头脑。
而孔武一个粗人，却比孙白杨有分寸，有克制。
孔武，爱的时候让对方无后顾之忧，给她未来给她憧憬；分开后就各自前行，退出对方生活；危急时刻有勇有谋，也能带领对方逃出牢笼。
反观孙白杨，过多的关心只能让对方身陷囹圄，还是舍不得退出；危急时刻听凭玉莹撒泼，没有足够的手段和能力带她逃走。
不能给对方未来，向对方多走一步都是多余的，相反最应该做的是后退一步。
真正爱一个人，不是自我放纵。孙白杨做不到，因奸情败露而葬身火海；孔武做到了，把一手烂牌打出了王者风范，带着爱人逃离了皇宫，奔向幸福的方向。
